Jon Urrutia estudia en el College for the Arts, de Arnhem, entre 1993 y 1996, año en que se matricula en la Universidad de la Sorbona de París para cursar el segundo año en la Facultad de Musicología y Gestión cultural.
Al acabar ese año lectivo (1997), sigue el camino que tantos jazzmen han emprendido, entrando a formar parte del alumnado del legendario Berklee College of Music de Boston: Allí se gradúa de la licenciatura en Jazz Performance en el año 2000.
A finales de los 90 registra un par de autoproducciones que datan de sus años en Boston y donde se rodea de cómplices de altísimo nivel: Es el caso de "Bilbao Blues", con George Garzone, Oscar Stagnaro (bajista actual de Paquito de Rivera), Patrick Cornelius, Ferenc Nemeth... Este disco permanece aún inédito.
El Berklee College of Music publicó también una colección de temas propios llamada "Jon Urrutia Latin & Blue", donde vuelven a acompañarle Stagnaro, Cornelius, Francisco Mela.... Todos estos proyectos, y otros como "Melasón" (2000), "Cocoboppers"(1998) o la Pati Zárate Demo(que supervisa Danilo Pérez en el 2000, y donde colabora Aquiles Baez poniendo su guitarra, como ya hizo en Calle 54 con Paquito D'Rivera) eran sobre todo ocasiones propicias para el intercambio y la experimentación entre compañeros y profesores de ese primerizo viaje al verdadero interior del jazz. Es característica afín a casi todos ellos el sabor latino que ahora Jon Urrutia domina como un lenguaje propio, pero también su preocupación por los polirritmos o la tradición de la música clásica y popular europea.
